Le capitaine Albator : héros principal de la série comme tout le monde le sait, il est le capitaine de l'Atlantis, vaisseau créé par Toshirô son plus fidèle ami. C'est d'ailleurs l'esprit de Toshiro qui anime l'ordinateur centrale (voir Albator 84). Respecté par ses adversaires il est également très craint. Lors de l'arrivée sur Terre des Sylvidres, il sera le seul à considérer les Sylvidres comme une menace pour l'espèce humaine. Il devra lutter à la fois contre ces femmes végétales, contre le gouvernement terrien représenté par Vilak et sauver la petite Stellie, fille de Toshiro et Emeraldas. Albator avait promis à Toshiro que Stellie serait élévée sur Terre.

Les sylvidres : ce sont des femmes végétales possédant une science que les terriens ne connaissent pas. Comme beaucoup de femmes leur extrème beauté est un danger. Arrivées en 2980 pour envahir la Terre, elles connaissent une seule et unique résistance : Albator. Leur particularité est que lors de leur mort, elles brûlent comme du papier.
Sylvidra est leur Reine. Ses relations avec Albator sont assez spéciales, il est son pire ennemi mais elle le respecte beaucoup. Sylvidra possède une particularité : un organisme sanguin, ce qui la différencie de son espèce.

Stellie : fille d'Esmeraldas et de Tochiro, elle est caractérisée par ses cheveux bleus. A de la mort de son père, Albator a juré qu'elle serait élevée sur la Terre. Albator lui offrit un ocarina à l'âge de 7 ans, instrument qu'elle maîtrise à merveille. Cet ocarina a un énorme pouvoir : en effet, l'ordinateur centrale de l'Atlantis animé par l'esprit de Toshiro peut réperer le son de l'ocarina n'importe où dans l'espace. Cette propriété sauvera plusieurs fois Stellie d'une mort certaine. En effet, clef de voûte de la série, elle sera à la fois capturée par les sylvidres et par Vilak.

La femme pirate : De son vrai nom Emeraldas, elle est la mère de la petite Stellie.

Ramis : Ce jeune garçon assiste à l'assasinat de son père par les sylvidres. Eminent scientifique, le professeur Valente avait découvert le projet d'erradication de l'espèce humaine par ces envahisseurs. Recueilli par Albator, Ramis intègre l'équipage de l'Atlantis. De caractère très dynamique, son courage et sa fougue compense son inexpérience et son impatience à combattre. Il apprendra beaucoup aux côtés d'Albator.

Vilak : Gouverneur de la Terre lors de l'arrivée des Sylvidres, il considère Albator comme un rénégat. Se servant de la petite Stellie pour attirer Albator dans des pièges, il sera vite dépasser par l'invasion Sylvidre. Personnage de mauvais caractère, ayant causé de nombreux problèmes, il se repentira en donnant sa vie pour sauver Stellie.

Nausicâa : officier supérieur de l'Atlantis, elle est très utile à l'Atlantis (voir aussi Albator 84).

L'équipage : il est composé de Clio la compagne d'Albator, d'Alfred le mécano, Suzanne la cuisinière, du docteur Zéro le médecin. Mais attention, la version française a fait une grosse erreur : Alfred n'est pas Alfred. Dans Albator 84, Alfred est Toshiro le constructeur du terrible Atlantis. Dans Albator 78, les français ont donné au mécano d'Albator le nom d'Alfred mais ce n'est pas Toshirô. Cet Alfred est passionné de maquettes et il sera toujours sans voix devant le génie "d'Alfred Toshiro".